Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMB4P28070 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms