Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAMP1P23763 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP1P23763 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms