Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD58P19256 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD58P19256 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD58P19256 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD58P19256 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD58P19256 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD58P19256 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD58P19256 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD58P19256 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD58P19256 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD58P19256 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD58P19256 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD58P19256 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD58P19256 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD58P19256 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD58P19256 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD58P19256 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD58P19256 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD58P19256 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD58P19256 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD58P19256 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD58P19256 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD58P19256 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD58P19256 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD58P19256 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD58P19256 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD58P19256 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CD58P19256 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD58P19256 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD58P19256 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD58P19256 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD58P19256 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD58P19256 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD58P19256 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD58P19256 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD58P19256 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD58P19256 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD58P19256 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD58P19256 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD58P19256 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD58P19256 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CD58P19256 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD58P19256 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD58P19256 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD58P19256 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD58P19256 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD58P19256 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD58P19256 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD58P19256 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD58P19256 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD58P19256 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD58P19256 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD58P19256 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD58P19256 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD58P19256 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CD58P19256 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD58P19256 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD58P19256 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD58P19256 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD58P19256 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CD58P19256 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CD58P19256 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CD58P19256 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD58P19256 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD58P19256 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD58P19256 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD58P19256 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD58P19256 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD58P19256 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD58P19256 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD58P19256 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD58P19256 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD58P19256 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD58P19256 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD58P19256 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD58P19256 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD58P19256 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms