Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN8P19075 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN8P19075 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN8P19075 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms