Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFD2P13995 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFD2P13995 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms