Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITGAMP11215 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAMP11215 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms