Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPN1P04843 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPN1P04843 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPN1P04843 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPN1P04843 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN1P04843 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN1P04843 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN1P04843 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN1P04843 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN1P04843 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN1P04843 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN1P04843 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN1P04843 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPN1P04843 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPN1P04843 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN1P04843 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN1P04843 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN1P04843 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN1P04843 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN1P04843 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN1P04843 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN1P04843 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPN1P04843 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPN1P04843 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPN1P04843 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPN1P04843 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RPN1P04843 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPN1P04843 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPN1P04843 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPN1P04843 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPN1P04843 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPN1P04843 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPN1P04843 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPN1P04843 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN1P04843 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN1P04843 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN1P04843 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN1P04843 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN1P04843 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN1P04843 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN1P04843 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPN1P04843 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPN1P04843 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPN1P04843 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPN1P04843 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPN1P04843 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPN1P04843 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPN1P04843 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms