Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3BO95985 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3BO95985 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms