Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPO95166 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPO95166 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms