Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD21O60216 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD21O60216 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD21O60216 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD21O60216 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD21O60216 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD21O60216 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD21O60216 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD21O60216 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD21O60216 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD21O60216 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD21O60216 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD21O60216 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD21O60216 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD21O60216 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD21O60216 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD21O60216 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD21O60216 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD21O60216 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD21O60216 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD21O60216 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD21O60216 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD21O60216 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD21O60216 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD21O60216 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD21O60216 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD21O60216 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD21O60216 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD21O60216 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD21O60216 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD21O60216 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD21O60216 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD21O60216 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD21O60216 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD21O60216 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD21O60216 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD21O60216 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD21O60216 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD21O60216 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD21O60216 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD21O60216 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD21O60216 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD21O60216 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAD21O60216 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAD21O60216 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAD21O60216 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD21O60216 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD21O60216 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD21O60216 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD21O60216 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD21O60216 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD21O60216 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD21O60216 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD21O60216 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD21O60216 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD21O60216 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD21O60216 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAD21O60216 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD21O60216 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD21O60216 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD21O60216 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD21O60216 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD21O60216 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD21O60216 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD21O60216 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD21O60216 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD21O60216 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD21O60216 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD21O60216 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD21O60216 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD21O60216 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD21O60216 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD21O60216 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD21O60216 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD21O60216 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD21O60216 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD21O60216 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD21O60216 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD21O60216 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD21O60216 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms