Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A4O43246 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC7A4O43246 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A4O43246 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms