Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PQ18 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PQ18 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PQ18 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PQ18 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PQ18 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PQ18 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PQ18 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PQ18 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PQ18 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PQ18 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PQ18 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PQ18 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PQ18 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PQ18 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PQ18 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PQ18 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PQ18 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PQ18 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PQ18 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PQ18 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PQ18 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PQ18 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PQ18 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PQ18 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PQ18 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PQ18 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PQ18 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PQ18 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PQ18 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PQ18 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PQ18 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PQ18 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PQ18 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PQ18 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PQ18 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PQ18 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PQ18 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PQ18 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PQ18 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PQ18 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PQ18 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PQ18 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PQ18 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms