Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALM3A6NDB9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PALM3A6NDB9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms