Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HES2Q9Y543 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HES2Q9Y543 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HES2Q9Y543 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.9 ms