Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDD3Q9Y3P4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms