Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL6Q9UKU0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 332.4 ms