Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
SCN11AQ9UI33 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN11AQ9UI33 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN11AQ9UI33 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms