Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRO2289Q9P1D8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms