Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms