Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD8Q9NX08 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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