Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPF1Q9NWY4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPF1Q9NWY4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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