Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRD1BQ9NQG5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPRD1BQ9NQG5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRD1BQ9NQG5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms