Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASS4Q9NQ75 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASS4Q9NQ75 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASS4Q9NQ75 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms