Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3GQ9HC16 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms