Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGQ9H9S0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NANOGQ9H9S0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms