Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCSER2Q9H7U1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER2Q9H7U1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER2Q9H7U1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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