Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1EQ9GZS1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1EQ9GZS1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR1EQ9GZS1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms