Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO4Q9GZR2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
REXO4Q9GZR2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms