Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms