Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PCGF6Q9BYE7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCGF6Q9BYE7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCGF6Q9BYE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 642.8 ms