Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP85Q9BW27 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP85Q9BW27 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms