Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFHD1Q9BUP0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms