Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUDCD1Q96RS6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms