Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC43Q96MW1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC43Q96MW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms