Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00615Q96LM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00615Q96LM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms