Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM71F1Q96KD3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.4 ms