Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX27Q96GQ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX27Q96GQ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms