Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC47Q96A33 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC47Q96A33 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms