Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSR2Q969E8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR2Q969E8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms