Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRIPQ8WXE1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms