Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms