Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00301Q8NCQ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms