Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED27Q6P2C8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED27Q6P2C8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms