Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDHAF4Q5VUM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDHAF4Q5VUM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms