Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM78BQ5VT40 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM78BQ5VT40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms