Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX2Q16385 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX2Q16385 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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