Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
NCOA1Q15788 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCOA1Q15788 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NCOA1Q15788 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA1Q15788 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
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