Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL19A1Q14993 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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