Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX3Q13761 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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