Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB3Q12988 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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